To increase the limit change max_input_vars

max_input_vars задаёт количество входных переменных, которое может быть принято в одном запросе. Если в запросе переменных больше чем задано в max_input_vars то операция не будет выполнена и вы увидите следующую ошибку в логах:

PHP Warning:  Unknown: Input variables exceeded 1000. To increase the limit change max_input_vars in php.ini

Для корректной работы ваших php скриптов редактируем php.ini параметр max_input_vars можно выставить в 5000

max_input_vars = 5000

если доступа к php.ini файлу у вас нет, переменную можно прописать в .htaccess

php_value max_input_vars 5000

Успехов !